A preservação ambiental do Rio Amazonas, assim como de seus afluentes e de toda a bacia hidrográfica, é fundamental para garantir o equilíbrio ecológico e ambiental desse ecossistema. Há na área da bacia Amazônica diversas unidades de proteção ambiental e reservas de povos indígenas, que são contribuintes da conservação da cobertura vegetacional local especialmente. Também há diversos projetos socioambientais, tanto públicos quanto privados, que buscam conservar as espécies de fauna e flora da região.
A preservação ambiental do Rio Amazonas é importante para a manutenção dos níveis de água local, para a conservação dos aspectos climáticos e vegetacionais regionais, e, ainda, para a valorização dos modos de vida da população ribeirinha.
